创新背景

肉鸡是最常见和最密集的畜牧生产系统之一，抗菌剂被广泛用于促进动物健康和生产性能。抗菌剂的持续使用导致了耐药细菌的出现，例如产生超广谱β-内酰胺酶的大肠杆菌（ESBL-Ec）。探索肉鸡盲肠微生物群的动态可以揭示实施干预策略的机会之窗，以减少耐药共生或致病细菌的传播。

创新过程

在商业农场进行全面生产期间，荷兰商业鸡群肉鸡盲肠微生物群中ESBL发育的研究发现，肉鸡可以在很小的时候通过多样化的微生物群保护免受产生ESBL的大肠杆菌的定植。

ESBL-Ec患病率和演替动态实验

瓦赫宁根大学的研究人员研究了商业鸡群中发育肉鸡在其生产生命周期（0-35天）中的盲肠微生物群的ESBL-Ec患病率和演替动态。在这项研究中，肉鸡分为两组：ESBL-Ec定植或ESBL-Ec非定植。所有肉鸡被关在同一个猪舍里。

研究比较了两组肉鸡的盲肠微生物群的丰富度、均匀度和组成。此外，还研究了年龄和ESBL-Ec状态对肉鸡盲肠微生物群的作用。研究人员在实验中观察到越来越多的ESBL-Ec定植肉鸡。在整个肉鸡的生产生命周期中，这一发展遵循线性趋势。

随着时间的推移，ESBL-Ec非定植肉鸡的盲肠微生物群丰富度一直较高。在实验的第三天，两个肉鸡组之间出现了差异，一个解释性数学研究模型显示出ESBL-Ec状态。模型表明，年龄影响盲肠微生物群组成变化的概率有14%。从第0天到第21天，微生物丰富度增加最多。

细菌组成

基于对ESBL-Ec在盲肠微生物群发育中发育肉鸡的演替动力学中的作用的研究，研究人员得出结论，ESBL-Ec的存在对发育中的肉鸡的盲肠微生物群没有一致的影响。所有肉鸡在第0天和第1天检测呈阴性，此后其患病率随着时间的推移迅速增加。研究得出结论，农场环境是ESBL最有可能的来源。研究同时强调了考虑宿主微生物群发育和耐药细菌定植的自然动态的重要性。

随着时间的推移，两个动物组中盲肠微生物群中大肠杆菌的相对丰度都降低了。肉鸡年龄的增长和微生物多样性增加导致细菌组成和丰度的变化。尽管大肠杆菌活性下降（相对丰度<5%），但ESBL-Ec的患病率在第35天很高。研究小组对此的一个可能的解释是，微生物群落的其他成员可能获得，携带和促进ESBL基因的传播。

创新关键点

研究通过肉鸡对照试验证明，年龄和ESBL-Ec状态影响肉鸡盲肠微生物群，多样化的盲肠微生物群会减少ESBL大肠杆菌的定植。